MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Xanthomonas campestris pv. campestris str. B100 chromosome

Total Repeats: 112978

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010688	CCCG	2	8	45	52	0 %	0 %	25 %	75 %	188989397
2	NC_010688	CGG	2	6	281	286	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188989397
3	NC_010688	GCA	2	6	356	361	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188989397
4	NC_010688	TGC	2	6	428	433	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188989397
5	NC_010688	GCA	2	6	440	445	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188989397
6	NC_010688	CGGC	2	8	476	483	0 %	0 %	50 %	50 %	188989397
7	NC_010688	GCC	2	6	508	513	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188989397
8	NC_010688	TTC	2	6	541	546	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	188989397
9	NC_010688	GAT	2	6	552	557	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	188989397
10	NC_010688	CG	3	6	559	564	0 %	0 %	50 %	50 %	188989397
11	NC_010688	CAG	2	6	604	609	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188989397
12	NC_010688	GCT	2	6	618	623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188989397
13	NC_010688	CGA	2	6	627	632	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188989397
14	NC_010688	T	6	6	640	645	0 %	100 %	0 %	0 %	188989397
15	NC_010688	CGCA	2	8	658	665	25 %	0 %	25 %	50 %	188989397
16	NC_010688	GGA	2	6	666	671	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	188989397
17	NC_010688	GCC	2	6	704	709	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188989397
18	NC_010688	ATC	2	6	715	720	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188989397
19	NC_010688	CG	3	6	740	745	0 %	0 %	50 %	50 %	188989397
20	NC_010688	GCCTG	2	10	779	788	0 %	20 %	40 %	40 %	188989397
21	NC_010688	CCG	2	6	811	816	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188989397
22	NC_010688	GC	3	6	853	858	0 %	0 %	50 %	50 %	188989397
23	NC_010688	GCG	2	6	863	868	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188989397
24	NC_010688	CGA	2	6	879	884	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188989397
25	NC_010688	AAG	2	6	904	909	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188989397
26	NC_010688	TGG	2	6	953	958	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	188989397
27	NC_010688	TGCG	2	8	1025	1032	0 %	25 %	50 %	25 %	188989397
28	NC_010688	CAG	3	9	1033	1041	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188989397
29	NC_010688	AGA	2	6	1064	1069	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188989397
30	NC_010688	ACT	2	6	1079	1084	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188989397
31	NC_010688	GC	3	6	1135	1140	0 %	0 %	50 %	50 %	188989397
32	NC_010688	GCCG	2	8	1213	1220	0 %	0 %	50 %	50 %	188989397
33	NC_010688	ACCAC	2	10	1223	1232	40 %	0 %	0 %	60 %	188989397
34	NC_010688	TGC	2	6	1235	1240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188989397
35	NC_010688	GGT	2	6	1652	1657	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	188989398
36	NC_010688	GTC	2	6	1662	1667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188989398
37	NC_010688	AAC	2	6	1716	1721	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	188989398
38	NC_010688	GACC	2	8	1742	1749	25 %	0 %	25 %	50 %	188989398
39	NC_010688	GC	3	6	1815	1820	0 %	0 %	50 %	50 %	188989398
40	NC_010688	CCTG	2	8	1844	1851	0 %	25 %	25 %	50 %	188989398
41	NC_010688	CAG	2	6	2043	2048	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188989398
42	NC_010688	TTA	2	6	2057	2062	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	188989398
43	NC_010688	CTG	2	6	2073	2078	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188989398
44	NC_010688	CTG	2	6	2097	2102	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188989398
45	NC_010688	ATC	2	6	2181	2186	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188989398
46	NC_010688	GCT	2	6	2210	2215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188989398
47	NC_010688	CTG	2	6	2220	2225	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188989398
48	NC_010688	GGC	2	6	2228	2233	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188989398
49	NC_010688	GAGCTG	2	12	2247	2258	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	188989398
50	NC_010688	GCG	2	6	2284	2289	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188989398
51	NC_010688	TCACCT	2	12	2293	2304	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	188989398
52	NC_010688	TGCG	2	8	2392	2399	0 %	25 %	50 %	25 %	188989398
53	NC_010688	GCG	2	6	2412	2417	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188989398
54	NC_010688	CGAA	2	8	2425	2432	50 %	0 %	25 %	25 %	188989398
55	NC_010688	GC	3	6	2482	2487	0 %	0 %	50 %	50 %	188989398
56	NC_010688	GAA	2	6	2502	2507	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188989398
57	NC_010688	GAT	2	6	2541	2546	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	188989398
58	NC_010688	CTG	2	6	2574	2579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188989398
59	NC_010688	CT	3	6	2586	2591	0 %	50 %	0 %	50 %	188989398
60	NC_010688	CGA	2	6	2600	2605	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188989398
61	NC_010688	TCG	2	6	2637	2642	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188989398
62	NC_010688	CGT	2	6	2681	2686	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188989398
63	NC_010688	GCA	2	6	3538	3543	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188989399
64	NC_010688	CGAT	2	8	3606	3613	25 %	25 %	25 %	25 %	188989399
65	NC_010688	TCCA	2	8	3630	3637	25 %	25 %	0 %	50 %	188989399
66	NC_010688	TCG	2	6	3644	3649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188989399
67	NC_010688	CCAG	2	8	3672	3679	25 %	0 %	25 %	50 %	188989399
68	NC_010688	GCC	2	6	3907	3912	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188989399
69	NC_010688	TG	3	6	3946	3951	0 %	50 %	50 %	0 %	188989399
70	NC_010688	GGT	2	6	3962	3967	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	188989399
71	NC_010688	GGC	2	6	4005	4010	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188989399
72	NC_010688	CGG	2	6	4017	4022	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188989399
73	NC_010688	CG	4	8	4085	4092	0 %	0 %	50 %	50 %	188989399
74	NC_010688	AGC	2	6	4099	4104	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188989399
75	NC_010688	CGG	2	6	4194	4199	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188989399
76	NC_010688	GCC	2	6	4300	4305	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188989399
77	NC_010688	CTG	2	6	4329	4334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188989399
78	NC_010688	GTT	2	6	4403	4408	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	188989399
79	NC_010688	GCCT	2	8	4467	4474	0 %	25 %	25 %	50 %	188989399
80	NC_010688	GGA	2	6	4487	4492	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	188989399
81	NC_010688	CAT	2	6	4520	4525	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188989399
82	NC_010688	GAT	2	6	4533	4538	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	188989399
83	NC_010688	TCA	3	9	4559	4567	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188989399
84	NC_010688	C	6	6	4632	4637	0 %	0 %	0 %	100 %	188989399
85	NC_010688	CCG	2	6	4719	4724	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188989399
86	NC_010688	CGA	2	6	4836	4841	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188989400
87	NC_010688	TGC	2	6	4895	4900	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188989400
88	NC_010688	ACG	2	6	4952	4957	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188989400
89	NC_010688	CAC	2	6	4969	4974	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	188989400
90	NC_010688	GGT	2	6	4986	4991	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	188989400
91	NC_010688	CGA	2	6	5004	5009	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188989400
92	NC_010688	GAA	2	6	5113	5118	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188989400
93	NC_010688	TGC	2	6	5150	5155	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188989400
94	NC_010688	CGG	2	6	5160	5165	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188989400
95	NC_010688	CGA	2	6	5172	5177	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188989400
96	NC_010688	CGG	2	6	5196	5201	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188989400
97	NC_010688	GGT	2	6	5223	5228	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	188989400
98	NC_010688	CAG	2	6	5284	5289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188989400
99	NC_010688	AGC	2	6	5324	5329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188989400
100	NC_010688	CAC	2	6	5352	5357	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	188989400
101	NC_010688	CGG	2	6	5372	5377	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188989400
102	NC_010688	GC	3	6	5419	5424	0 %	0 %	50 %	50 %	188989400
103	NC_010688	CGA	2	6	5475	5480	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188989400
104	NC_010688	GCG	2	6	5483	5488	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188989400
105	NC_010688	CGA	2	6	5499	5504	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188989400
106	NC_010688	GGC	2	6	5518	5523	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188989400
107	NC_010688	GTG	2	6	5611	5616	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	188989400
108	NC_010688	GGC	2	6	5692	5697	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188989400
109	NC_010688	CG	3	6	5729	5734	0 %	0 %	50 %	50 %	188989400
110	NC_010688	CGA	2	6	5796	5801	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188989400
111	NC_010688	CGG	2	6	5900	5905	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188989400
112	NC_010688	GC	3	6	5923	5928	0 %	0 %	50 %	50 %	188989400
113	NC_010688	CGAA	2	8	5954	5961	50 %	0 %	25 %	25 %	188989400
114	NC_010688	TCG	2	6	5984	5989	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188989400
115	NC_010688	GCC	2	6	5992	5997	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188989400
116	NC_010688	GCC	2	6	6010	6015	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188989400
117	NC_010688	GC	3	6	6022	6027	0 %	0 %	50 %	50 %	188989400
118	NC_010688	CGC	2	6	6037	6042	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188989400
119	NC_010688	GC	3	6	6047	6052	0 %	0 %	50 %	50 %	188989400
120	NC_010688	TCG	2	6	6125	6130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188989400
121	NC_010688	CCGCAA	2	12	6165	6176	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	188989400
122	NC_010688	TGC	2	6	6188	6193	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188989400
123	NC_010688	CG	4	8	6223	6230	0 %	0 %	50 %	50 %	188989400
124	NC_010688	CGA	2	6	6300	6305	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188989400
125	NC_010688	ACC	2	6	6329	6334	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	188989400
126	NC_010688	CAT	2	6	6336	6341	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188989400
127	NC_010688	TGA	2	6	6344	6349	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	188989400
128	NC_010688	CCGACG	2	12	6350	6361	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	188989400
129	NC_010688	GCT	3	9	6384	6392	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188989400
130	NC_010688	TTC	2	6	6397	6402	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	188989400
131	NC_010688	CTACAT	2	12	6435	6446	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188989400
132	NC_010688	GCC	2	6	6453	6458	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188989400
133	NC_010688	GAC	2	6	6502	6507	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188989400
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263	NC_010688	CGC	3	9	11314	11322	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188989405
264	NC_010688	CCT	2	6	11457	11462	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	188989405
265	NC_010688	TCA	2	6	11475	11480	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188989405
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269	NC_010688	CAC	2	6	11639	11644	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	188989405
270	NC_010688	GCA	2	6	11658	11663	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188989405
271	NC_010688	CGG	2	6	11665	11670	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188989405
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273	NC_010688	CTG	2	6	11765	11770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188989405
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275	NC_010688	GC	3	6	11832	11837	0 %	0 %	50 %	50 %	188989405
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279	NC_010688	CTT	2	6	12025	12030	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	188989405
280	NC_010688	CG	3	6	12042	12047	0 %	0 %	50 %	50 %	188989405
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287	NC_010688	GAAG	2	8	12260	12267	50 %	0 %	50 %	0 %	188989406
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